Pierre M. Trudeau a fait des études en cinéma à l'Université Concordia de Montréal (Beaux-arts, option animation). Il fonde Ciné-Clic avec un groupe de cinéastes, permettant de produire des messages d’intérêts publics. Il réalise par la suite une quinzaine de films d'animation dont Last Call Blues (1985) et Buston Keater (1986). Lauréat du concours «Cinéaste recherché(e)», édition 1987-1988, il réalise son premier film à l'ONF, Enfantillage (1990), un film bouleversant sur le thème de la violence conjugale qui combine animation de marionnettes et dessins sur papier.  Ce film révèlera par ailleurs le style singulier de Pierre M. Trudeau et son talent à concevoir des marionnettes à partir de papier construction. Viennent ensuite deux films de la collection Droits au coeur destinée au jeune public : 1, 2, 3, Coco (1991) et Baroque’n Roll (1994), tous deux réalisés en animation de marionnettes. Ses films mettant en vedette un attachant coucou d'horloge répondant au nom d'Edgar, Coucou ! Monsieur Edgar (1999) et Opération Coucou (2002), deux courts métrages à la fois drôles et touchants sur la paternité apprivoisée, ont été réalisés en animation 3D par ordinateur. Après un séjour en France comme animateur sur le film Ruzz et Ben (2004), il produit et réalise à compte d’auteur Les Anges Déchets (2008) en objets recyclés et animation 3D, Triptyque: Tripes, entrailles, viscères (2012) et Raised to be Hero (2013).